人们越来越多地认识到，生命早期的肠道微生物群是造成短期和/或长期人类健康和疾病的主要因素。大量研究表明，人类肠道微生物定植于出生时就开始了，但会在两到三年内继续发展一系列分类丰度，直到肠道微生物群达到成人般的多样性和比例。包括胎龄 (GA)、分娩方式、出生体重、喂养类型、抗生素暴露、母体微生物组和饮食在内的几个因素会影响生命早期肠道微生物群的多样性、丰度和功能。

肠道微生物对于帮助消化食物物质以释放营养、控制病原体、刺激或调节免疫系统以及影响许多系统(如大脑、和内分泌系统等)。微生物代谢物在这些相互作用中发挥多种作用。此外，研究提供的证据支持生命早期肠道微生物群的失衡(称为生态失调)与特定的儿童或成人疾病结果有关，例如哮喘、特应性皮炎、过敏性疾病、肥胖症、心血管疾病 (CVD) , 和神经系统疾病。这些发现支持人类肠道微生物群可能在获得可能在生命早期被编程的疾病的风险中发挥重要作用。

事实上，探索人类肠道微生物群在生命早期的作用至关重要。称为生态失调，与特定的儿童或成人疾病结果相关，例如哮喘、特应性皮炎、过敏性疾病、肥胖症、心血管疾病 (CVD) 和神经系统疾病。这些发现支持人类肠道微生物群可能在获得可能在生命早期被编程的疾病的风险中发挥重要作用。

影响生命早期微生物组丰富度和丰度的重要因素。生命的早期可以分为母亲的怀孕、分娩和婴儿期。在每个阶段，有几个因素可能会影响婴儿的肠道微生物群，包括母亲的健康和习惯、当地环境、宿主遗传以及抗生素等药物的使用。